MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4a

Total Repeats: 1266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011986	ATC	2	6	29016	29021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102358
502	NC_011986	GGGT	2	8	29048	29055	0 %	25 %	75 %	0 %	222102358
503	NC_011986	CAC	2	6	29175	29180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102358
504	NC_011986	CGC	2	6	29204	29209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102358
505	NC_011986	AAGC	2	8	29475	29482	50 %	0 %	25 %	25 %	222102359
506	NC_011986	CGAT	2	8	29508	29515	25 %	25 %	25 %	25 %	222102359
507	NC_011986	AGC	2	6	29533	29538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102359
508	NC_011986	TCT	2	6	29600	29605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102359
509	NC_011986	AAG	2	6	29614	29619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102359
510	NC_011986	GGACGA	2	12	29654	29665	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222102359
511	NC_011986	CGG	2	6	29688	29693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102359
512	NC_011986	GAC	2	6	29698	29703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102359
513	NC_011986	ATGGCT	2	12	29812	29823	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222102359
514	NC_011986	ATC	2	6	29940	29945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102359
515	NC_011986	GCG	2	6	29956	29961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102359
516	NC_011986	CGG	2	6	30086	30091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102359
517	NC_011986	GAC	2	6	30101	30106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102359
518	NC_011986	ACG	2	6	30168	30173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102359
519	NC_011986	GCCC	2	8	30216	30223	0 %	0 %	25 %	75 %	222102359
520	NC_011986	GA	3	6	30273	30278	50 %	0 %	50 %	0 %	222102359
521	NC_011986	TTC	2	6	30309	30314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102359
522	NC_011986	GCG	2	6	30377	30382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102359
523	NC_011986	GC	3	6	30398	30403	0 %	0 %	50 %	50 %	222102359
524	NC_011986	GC	3	6	30422	30427	0 %	0 %	50 %	50 %	222102359
525	NC_011986	CTGC	2	8	30441	30448	0 %	25 %	25 %	50 %	222102359
526	NC_011986	ACG	2	6	30699	30704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102359
527	NC_011986	CA	3	6	30708	30713	50 %	0 %	0 %	50 %	222102359
528	NC_011986	AGC	2	6	30725	30730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102359
529	NC_011986	TC	3	6	30821	30826	0 %	50 %	0 %	50 %	222102359
530	NC_011986	GCC	2	6	30974	30979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102359
531	NC_011986	CTA	2	6	31004	31009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102359
532	NC_011986	AAG	2	6	31015	31020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102359
533	NC_011986	GC	3	6	31060	31065	0 %	0 %	50 %	50 %	222102360
534	NC_011986	AGC	2	6	31108	31113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102360
535	NC_011986	TGA	2	6	31136	31141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102360
536	NC_011986	TCGA	2	8	31239	31246	25 %	25 %	25 %	25 %	222102360
537	NC_011986	TGCG	2	8	31376	31383	0 %	25 %	50 %	25 %	222102360
538	NC_011986	GGC	2	6	31397	31402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102360
539	NC_011986	CTG	2	6	31575	31580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102360
540	NC_011986	ATCA	2	8	31791	31798	50 %	25 %	0 %	25 %	222102360
541	NC_011986	CAAG	2	8	32047	32054	50 %	0 %	25 %	25 %	222102361
542	NC_011986	ACG	2	6	32055	32060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102361
543	NC_011986	TC	3	6	32068	32073	0 %	50 %	0 %	50 %	222102361
544	NC_011986	TCCC	2	8	32126	32133	0 %	25 %	0 %	75 %	222102361
545	NC_011986	GCG	2	6	32139	32144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102361
546	NC_011986	ATC	2	6	32147	32152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102361
547	NC_011986	GAA	2	6	32201	32206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102361
548	NC_011986	GAT	2	6	32368	32373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102361
549	NC_011986	GCT	2	6	32425	32430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102362
550	NC_011986	TAT	2	6	32450	32455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102362
551	NC_011986	GTC	2	6	32459	32464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102362
552	NC_011986	ATG	2	6	32645	32650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102362
553	NC_011986	CAT	2	6	32662	32667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102362
554	NC_011986	ACC	2	6	32687	32692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102362
555	NC_011986	CGCC	2	8	32839	32846	0 %	0 %	25 %	75 %	222102362
556	NC_011986	TGGC	2	8	32854	32861	0 %	25 %	50 %	25 %	222102362
557	NC_011986	CGG	2	6	32924	32929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102362
558	NC_011986	TCA	2	6	32953	32958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102362
559	NC_011986	CATC	2	8	33103	33110	25 %	25 %	0 %	50 %	222102362
560	NC_011986	ACC	2	6	33177	33182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102362
561	NC_011986	GAA	2	6	33227	33232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102362
562	NC_011986	TAC	2	6	33236	33241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102362
563	NC_011986	GCCA	2	8	33256	33263	25 %	0 %	25 %	50 %	222102362
564	NC_011986	AGA	2	6	33860	33865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102363
565	NC_011986	CTT	2	6	34024	34029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102363
566	NC_011986	CGC	2	6	34153	34158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102363
567	NC_011986	ACCGT	2	10	34164	34173	20 %	20 %	20 %	40 %	222102363
568	NC_011986	GCC	2	6	34205	34210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102363
569	NC_011986	TTC	2	6	34235	34240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102363
570	NC_011986	CGC	2	6	34278	34283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102363
571	NC_011986	CGT	2	6	34285	34290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102363
572	NC_011986	CGA	2	6	34381	34386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102363
573	NC_011986	CGC	2	6	34478	34483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102363
574	NC_011986	CGC	2	6	34488	34493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102363
575	NC_011986	CGA	2	6	34531	34536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102363
576	NC_011986	GAA	2	6	34547	34552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102363
577	NC_011986	GCCT	2	8	34590	34597	0 %	25 %	25 %	50 %	222102363
578	NC_011986	CG	3	6	34615	34620	0 %	0 %	50 %	50 %	222102363
579	NC_011986	CAG	2	6	34622	34627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102363
580	NC_011986	GAA	2	6	34682	34687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102363
581	NC_011986	TGA	2	6	34719	34724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102363
582	NC_011986	ATG	2	6	34734	34739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102363
583	NC_011986	TCG	2	6	34771	34776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102363
584	NC_011986	ACG	2	6	34782	34787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102363
585	NC_011986	GAAT	2	8	34828	34835	50 %	25 %	25 %	0 %	222102363
586	NC_011986	GGC	2	6	34922	34927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102363
587	NC_011986	GGT	2	6	35036	35041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102363
588	NC_011986	CAC	2	6	35093	35098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102363
589	NC_011986	GAT	2	6	35154	35159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102363
590	NC_011986	T	6	6	35159	35164	0 %	100 %	0 %	0 %	222102363
591	NC_011986	CGA	2	6	35300	35305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102364
592	NC_011986	CCTT	2	8	35320	35327	0 %	50 %	0 %	50 %	222102364
593	NC_011986	CTT	2	6	35421	35426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102364
594	NC_011986	CTT	2	6	35442	35447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102364
595	NC_011986	CCG	2	6	35507	35512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102364
596	NC_011986	TGA	2	6	35525	35530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102364
597	NC_011986	CTT	2	6	35566	35571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102365
598	NC_011986	CGT	2	6	35601	35606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102365
599	NC_011986	GAT	2	6	35662	35667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102365
600	NC_011986	GAAC	2	8	35778	35785	50 %	0 %	25 %	25 %	222102365
601	NC_011986	ATC	2	6	35867	35872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102365
602	NC_011986	CTT	2	6	35926	35931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102365
603	NC_011986	ACT	2	6	36020	36025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102365
604	NC_011986	GTAA	2	8	36026	36033	50 %	25 %	25 %	0 %	222102365
605	NC_011986	GTT	2	6	36191	36196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102366
606	NC_011986	TTTG	2	8	36439	36446	0 %	75 %	25 %	0 %	222102366
607	NC_011986	GAC	2	6	36665	36670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102367
608	NC_011986	ACG	2	6	36674	36679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102367
609	NC_011986	CAG	2	6	36756	36761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102367
610	NC_011986	TTG	2	6	36789	36794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102367
611	NC_011986	GAT	2	6	36799	36804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102367
612	NC_011986	GCA	2	6	36845	36850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102367
613	NC_011986	GAT	2	6	36896	36901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102367
614	NC_011986	C	6	6	36997	37002	0 %	0 %	0 %	100 %	222102367
615	NC_011986	TCG	2	6	37053	37058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102367
616	NC_011986	ACT	2	6	37064	37069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102367
617	NC_011986	TGA	2	6	37128	37133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102367
618	NC_011986	A	6	6	37173	37178	100 %	0 %	0 %	0 %	222102367
619	NC_011986	GTC	2	6	37211	37216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102367
620	NC_011986	CCG	2	6	37336	37341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102368
621	NC_011986	TAT	2	6	37352	37357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102368
622	NC_011986	GTT	2	6	37416	37421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102368
623	NC_011986	GAC	2	6	37431	37436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102368
624	NC_011986	GC	3	6	37491	37496	0 %	0 %	50 %	50 %	222102368
625	NC_011986	GAT	2	6	37517	37522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102368
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627	NC_011986	CAC	2	6	37669	37674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102368
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752	NC_011986	GCG	2	6	45105	45110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102378
753	NC_011986	CGT	2	6	45113	45118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102378
754	NC_011986	TTG	2	6	45120	45125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102378
755	NC_011986	GTC	3	9	45186	45194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102378
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757	NC_011986	GCC	2	6	45221	45226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102378
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873	NC_011986	GTCC	2	8	51973	51980	0 %	25 %	25 %	50 %	222102384
874	NC_011986	GAG	2	6	52139	52144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102385
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878	NC_011986	GTC	2	6	52497	52502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102385
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995	NC_011986	CA	3	6	59469	59474	50 %	0 %	0 %	50 %	222102391
996	NC_011986	CAAT	2	8	59543	59550	50 %	25 %	0 %	25 %	222102391
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999	NC_011986	CGC	2	6	59594	59599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102391
1000	NC_011986	ATC	2	6	59610	59615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102391

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